O Laboratório de Doenças Infecciosas e Parasitárias (LDIP) foi criado em 2005 com o objetivo de estudar os agentes etiológicos de doenças infecciosas e parasitárias, bem como os vetores causadores delas, em temas considerados prioritários para a saúde latino-americana. As principais áreas de atuação do LDIP são: Parasitologia Humana e Animal, e Parasitologia Molecular. As pesquisas conduzidas no LDIP incluem: O mapeamento de focos endêmicos de esquistossomose mansônica e avaliação das ações de controle do PCE; Avaliação parasitológica de moluscos vetores de parasitoses; Avaliação ecoepidemiológica de tripanossomatídeos, com foco em tripanossomíase americana e leishmaniose; Avaliação parasitológica de animais de importância na cadeia produtiva regional (ostras, mexilhões, peixes, caprinos e suínos) e da fauna regional; Avaliação da dinâmica populacional de triatomíneos, flebótomos, e Aedes aegypti, e do grau de risco de transmissão de doenças de impacto regional; Controle de vetores e ectoparasitas; Mapeamento parasitológico de reservatórios hídricos e doenças de veiculação hídrica.